Probléme aprés réception

Bonjour,
Nous avons réceptionné notre maison en aout 2013, maisons construite avec maisons patrimoine (Rhône et Isère).
A ce jour, nous avons constaté plusieurs anomalies qui pour certaines ont été réparées;
Les escaliers intérieurs par exemple avaient des marches de hauteur et profondeur différentes. Le maçon qui les a fait n'a pas voulu réintervenir dessus en invoquant le fait qu'il avait fait constaté à Maisons Patrimoine bien avant la conception des escaliers que l'emplacement laissé pour la réalisation des escaliers n'était pas suffisant et la réponse du constructeur a été "faites au mieux";
Le constructeur a du faire appel à un autre maçon pour refaire l'escalier qui est mieux mais toujours pas au norme.
Nous avions déjà réalisé les peintures intérieures et cette réintervention a endommagé les peintures; Nous avons demandé au constructeur de les refaire et sa réponse a été que cette prestation ne figurait pas initialement au contrat donc qu'il n'avait pas a réparé ce dommage.
Second problème, les baies de la pièce de vie claquent au moindre coup de vent et du polystyrène isolant s'échappe d'entre le mur et la baie.
La personne qui a posé ces baies l' a constaté et nous a fait remarqué qu'au cours du chantier il avait signalé que les baies étaient trop petites par rapport à l'emplacement prévu et le conducteur des travaux pour combler ce vide a injecté de la mousse polyuréthane. il n'y a pas de linteau qui permettrait de fixer ces baies.
A savoir que cette maison a un label BBC et que le label a été délivré, on se demande comment avec ces fuites d'air!
D'autres problèmes sont présents;
Nous avons fait un recommandé avec AR pour énumérer tous ces problèmes;
Nous aimerions faire constater ces différents problèmes. Pourriez vous m'indiquer comment procéder.
merci pour vos réponses.