Acceptation Prim Renov apres avoir désossé la maison

Bonjour, 

Nous avons acheté une maison de 1928 avec un DPE en D. Après quelques sondages c'est la douche froide onnse rend compte que la laine de verre est à refaire et est même parfois imbibée d'eau à cause d'un problème que l'on ne pouvait pas voir sous la toiture que lon doit renforcer. Nous décidons donc de déposer tout le placo et l'isolation pour repartir à zéro et tout refaire avec une bonne isolation car nous avons appris en plus que la locataire avait très froid en hiver et extrement chaud en été. 
ma prim renov stipule bien de ne pas avoir commencé les travaux avant de faire la demande. Mais pour nous les conditions parlent des travaux énergétiques et non de maçonnerie. maintenant que la maison est désossée l'audit énergétique va t il se baser sur l'état actuel de la maison ou sur le précédent DPE ? 
La prim renov peut elle nous etre refusée ? 

Merci par avance, 

Melanie